Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 ANO6-203ENST00000425752 3558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 MKL1-210ENST00000614754 3917 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 FAM237B-201ENST00000637645 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms