Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms