Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VTNP04004 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VTNP04004 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VTNP04004 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VTNP04004 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VTNP04004 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VTNP04004 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VTNP04004 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VTNP04004 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VTNP04004 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VTNP04004 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VTNP04004 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VTNP04004 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VTNP04004 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VTNP04004 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VTNP04004 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VTNP04004 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VTNP04004 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VTNP04004 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VTNP04004 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VTNP04004 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VTNP04004 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VTNP04004 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VTNP04004 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VTNP04004 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VTNP04004 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VTNP04004 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VTNP04004 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VTNP04004 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VTNP04004 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VTNP04004 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VTNP04004 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VTNP04004 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VTNP04004 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VTNP04004 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VTNP04004 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VTNP04004 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VTNP04004 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VTNP04004 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VTNP04004 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VTNP04004 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VTNP04004 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VTNP04004 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VTNP04004 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VTNP04004 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VTNP04004 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms