Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 MKL1-210ENST00000614754 3917 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 MESD-201ENST00000261758 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 ZNF571-AS1-203ENST00000586139 2684 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SMIM1B2RUZ4 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
SMIM1B2RUZ4 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
SMIM1B2RUZ4 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SMIM1B2RUZ4 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SMIM1B2RUZ4 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SMIM1B2RUZ4 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
SMIM1B2RUZ4 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SMIM1B2RUZ4 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SMIM1B2RUZ4 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
SMIM1B2RUZ4 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC9.46□□□□□ -0.9
SMIM1B2RUZ4 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
SMIM1B2RUZ4 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
SMIM1B2RUZ4 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
SMIM1B2RUZ4 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SMIM1B2RUZ4 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
SMIM1B2RUZ4 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
SMIM1B2RUZ4 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
SMIM1B2RUZ4 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
SMIM1B2RUZ4 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
SMIM1B2RUZ4 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
SMIM1B2RUZ4 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SMIM1B2RUZ4 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
SMIM1B2RUZ4 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SMIM1B2RUZ4 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
SMIM1B2RUZ4 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC9.46□□□□□ -0.9
SMIM1B2RUZ4 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
SMIM1B2RUZ4 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
SMIM1B2RUZ4 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
SMIM1B2RUZ4 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SMIM1B2RUZ4 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
SMIM1B2RUZ4 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
SMIM1B2RUZ4 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SMIM1B2RUZ4 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
SMIM1B2RUZ4 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
SMIM1B2RUZ4 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms