Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 FUNDC1-201ENST00000378045 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 AC114812.4-201ENST00000506676 757 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 ARCN1-204ENST00000534182 1669 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 TUBD1-202ENST00000340993 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms