Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC4A4Q9Y6R1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms