Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP16Q9Y5T5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
USP16Q9Y5T5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP16Q9Y5T5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP16Q9Y5T5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP16Q9Y5T5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP16Q9Y5T5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP16Q9Y5T5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP16Q9Y5T5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
USP16Q9Y5T5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP16Q9Y5T5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP16Q9Y5T5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP16Q9Y5T5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP16Q9Y5T5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP16Q9Y5T5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP16Q9Y5T5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP16Q9Y5T5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP16Q9Y5T5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP16Q9Y5T5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP16Q9Y5T5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP16Q9Y5T5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP16Q9Y5T5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP16Q9Y5T5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP16Q9Y5T5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP16Q9Y5T5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP16Q9Y5T5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP16Q9Y5T5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP16Q9Y5T5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP16Q9Y5T5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP16Q9Y5T5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP16Q9Y5T5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP16Q9Y5T5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP16Q9Y5T5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP16Q9Y5T5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP16Q9Y5T5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP16Q9Y5T5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP16Q9Y5T5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP16Q9Y5T5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP16Q9Y5T5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP16Q9Y5T5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP16Q9Y5T5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP16Q9Y5T5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP16Q9Y5T5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP16Q9Y5T5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
USP16Q9Y5T5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP16Q9Y5T5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP16Q9Y5T5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP16Q9Y5T5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
USP16Q9Y5T5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP16Q9Y5T5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP16Q9Y5T5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP16Q9Y5T5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP16Q9Y5T5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms