Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHLDA3Q9Y5J5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms