Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FARP1Q9Y4F1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FARP1Q9Y4F1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms