Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
RAD54L2Q9Y4B4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
RAD54L2Q9Y4B4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
RAD54L2Q9Y4B4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
RAD54L2Q9Y4B4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
RAD54L2Q9Y4B4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
RAD54L2Q9Y4B4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
RAD54L2Q9Y4B4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
RAD54L2Q9Y4B4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
RAD54L2Q9Y4B4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
RAD54L2Q9Y4B4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
RAD54L2Q9Y4B4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC37.88■■■■□ 3.65
RAD54L2Q9Y4B4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
RAD54L2Q9Y4B4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC37.88■■■■□ 3.65
RAD54L2Q9Y4B4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
RAD54L2Q9Y4B4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
RAD54L2Q9Y4B4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
RAD54L2Q9Y4B4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
RAD54L2Q9Y4B4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
RAD54L2Q9Y4B4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
RAD54L2Q9Y4B4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
RAD54L2Q9Y4B4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
RAD54L2Q9Y4B4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC37.87■■■■□ 3.65
RAD54L2Q9Y4B4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
RAD54L2Q9Y4B4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
RAD54L2Q9Y4B4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
RAD54L2Q9Y4B4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
RAD54L2Q9Y4B4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
RAD54L2Q9Y4B4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
RAD54L2Q9Y4B4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
RAD54L2Q9Y4B4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
RAD54L2Q9Y4B4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
RAD54L2Q9Y4B4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC37.85■■■■□ 3.65
RAD54L2Q9Y4B4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
RAD54L2Q9Y4B4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
RAD54L2Q9Y4B4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
RAD54L2Q9Y4B4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
RAD54L2Q9Y4B4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
RAD54L2Q9Y4B4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
RAD54L2Q9Y4B4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
RAD54L2Q9Y4B4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
RAD54L2Q9Y4B4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
RAD54L2Q9Y4B4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
RAD54L2Q9Y4B4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
RAD54L2Q9Y4B4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
RAD54L2Q9Y4B4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
RAD54L2Q9Y4B4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
RAD54L2Q9Y4B4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
RAD54L2Q9Y4B4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
RAD54L2Q9Y4B4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
RAD54L2Q9Y4B4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
RAD54L2Q9Y4B4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.65
RAD54L2Q9Y4B4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
RAD54L2Q9Y4B4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
RAD54L2Q9Y4B4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
RAD54L2Q9Y4B4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
RAD54L2Q9Y4B4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
RAD54L2Q9Y4B4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
RAD54L2Q9Y4B4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
RAD54L2Q9Y4B4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
RAD54L2Q9Y4B4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
RAD54L2Q9Y4B4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
RAD54L2Q9Y4B4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
RAD54L2Q9Y4B4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
RAD54L2Q9Y4B4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
RAD54L2Q9Y4B4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
RAD54L2Q9Y4B4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
RAD54L2Q9Y4B4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
RAD54L2Q9Y4B4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
RAD54L2Q9Y4B4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
RAD54L2Q9Y4B4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
RAD54L2Q9Y4B4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
RAD54L2Q9Y4B4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
RAD54L2Q9Y4B4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
RAD54L2Q9Y4B4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
RAD54L2Q9Y4B4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
RAD54L2Q9Y4B4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
RAD54L2Q9Y4B4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
RAD54L2Q9Y4B4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
RAD54L2Q9Y4B4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
RAD54L2Q9Y4B4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
RAD54L2Q9Y4B4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
RAD54L2Q9Y4B4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
RAD54L2Q9Y4B4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
RAD54L2Q9Y4B4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
RAD54L2Q9Y4B4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
RAD54L2Q9Y4B4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
RAD54L2Q9Y4B4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC37.76■■■■□ 3.63
RAD54L2Q9Y4B4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
RAD54L2Q9Y4B4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
RAD54L2Q9Y4B4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
RAD54L2Q9Y4B4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
RAD54L2Q9Y4B4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
RAD54L2Q9Y4B4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
RAD54L2Q9Y4B4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC37.75■■■■□ 3.63
RAD54L2Q9Y4B4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
RAD54L2Q9Y4B4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms