Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFE2L3Q9Y4A8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
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