Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E7

CHMP3, Charged multivesicular body protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP3Q9Y3E7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHMP3Q9Y3E7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CHMP3Q9Y3E7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHMP3Q9Y3E7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CHMP3Q9Y3E7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CHMP3Q9Y3E7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHMP3Q9Y3E7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHMP3Q9Y3E7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CHMP3Q9Y3E7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHMP3Q9Y3E7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHMP3Q9Y3E7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHMP3Q9Y3E7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHMP3Q9Y3E7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHMP3Q9Y3E7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CHMP3Q9Y3E7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHMP3Q9Y3E7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHMP3Q9Y3E7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHMP3Q9Y3E7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CHMP3Q9Y3E7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHMP3Q9Y3E7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHMP3Q9Y3E7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHMP3Q9Y3E7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHMP3Q9Y3E7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHMP3Q9Y3E7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHMP3Q9Y3E7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHMP3Q9Y3E7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHMP3Q9Y3E7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHMP3Q9Y3E7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHMP3Q9Y3E7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHMP3Q9Y3E7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHMP3Q9Y3E7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHMP3Q9Y3E7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHMP3Q9Y3E7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHMP3Q9Y3E7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHMP3Q9Y3E7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHMP3Q9Y3E7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CHMP3Q9Y3E7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHMP3Q9Y3E7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHMP3Q9Y3E7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHMP3Q9Y3E7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHMP3Q9Y3E7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHMP3Q9Y3E7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CHMP3Q9Y3E7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CHMP3Q9Y3E7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CHMP3Q9Y3E7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CHMP3Q9Y3E7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms