Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAB39Q9Y376 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms