Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
THRAP3Q9Y2W1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
THRAP3Q9Y2W1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
THRAP3Q9Y2W1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
THRAP3Q9Y2W1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
THRAP3Q9Y2W1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
THRAP3Q9Y2W1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
THRAP3Q9Y2W1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
THRAP3Q9Y2W1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
THRAP3Q9Y2W1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
THRAP3Q9Y2W1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
THRAP3Q9Y2W1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
THRAP3Q9Y2W1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
THRAP3Q9Y2W1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
THRAP3Q9Y2W1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
THRAP3Q9Y2W1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
THRAP3Q9Y2W1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
THRAP3Q9Y2W1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
THRAP3Q9Y2W1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
THRAP3Q9Y2W1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
THRAP3Q9Y2W1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
THRAP3Q9Y2W1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
THRAP3Q9Y2W1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
THRAP3Q9Y2W1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
THRAP3Q9Y2W1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
THRAP3Q9Y2W1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
THRAP3Q9Y2W1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
THRAP3Q9Y2W1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
THRAP3Q9Y2W1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
THRAP3Q9Y2W1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
THRAP3Q9Y2W1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
THRAP3Q9Y2W1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
THRAP3Q9Y2W1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
THRAP3Q9Y2W1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
THRAP3Q9Y2W1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
THRAP3Q9Y2W1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
THRAP3Q9Y2W1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
THRAP3Q9Y2W1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
THRAP3Q9Y2W1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
THRAP3Q9Y2W1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
THRAP3Q9Y2W1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms