Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T2

AP3M1, AP-3 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M1Q9Y2T2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP3M1Q9Y2T2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
AP3M1Q9Y2T2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
AP3M1Q9Y2T2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
AP3M1Q9Y2T2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
AP3M1Q9Y2T2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
AP3M1Q9Y2T2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
AP3M1Q9Y2T2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP3M1Q9Y2T2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP3M1Q9Y2T2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP3M1Q9Y2T2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP3M1Q9Y2T2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP3M1Q9Y2T2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP3M1Q9Y2T2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP3M1Q9Y2T2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP3M1Q9Y2T2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP3M1Q9Y2T2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP3M1Q9Y2T2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP3M1Q9Y2T2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP3M1Q9Y2T2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP3M1Q9Y2T2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP3M1Q9Y2T2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP3M1Q9Y2T2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP3M1Q9Y2T2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP3M1Q9Y2T2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP3M1Q9Y2T2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
AP3M1Q9Y2T2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP3M1Q9Y2T2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
AP3M1Q9Y2T2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP3M1Q9Y2T2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP3M1Q9Y2T2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms