Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms