Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
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