Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TRAK1Q9UPV9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TRAK1Q9UPV9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TRAK1Q9UPV9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TRAK1Q9UPV9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TRAK1Q9UPV9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
TRAK1Q9UPV9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TRAK1Q9UPV9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TRAK1Q9UPV9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TRAK1Q9UPV9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TRAK1Q9UPV9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TRAK1Q9UPV9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TRAK1Q9UPV9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TRAK1Q9UPV9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TRAK1Q9UPV9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TRAK1Q9UPV9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TRAK1Q9UPV9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TRAK1Q9UPV9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TRAK1Q9UPV9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TRAK1Q9UPV9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TRAK1Q9UPV9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TRAK1Q9UPV9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TRAK1Q9UPV9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TRAK1Q9UPV9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TRAK1Q9UPV9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TRAK1Q9UPV9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TRAK1Q9UPV9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TRAK1Q9UPV9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TRAK1Q9UPV9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TRAK1Q9UPV9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
TRAK1Q9UPV9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
TRAK1Q9UPV9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.65
TRAK1Q9UPV9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
TRAK1Q9UPV9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
TRAK1Q9UPV9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
TRAK1Q9UPV9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TRAK1Q9UPV9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
TRAK1Q9UPV9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TRAK1Q9UPV9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TRAK1Q9UPV9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TRAK1Q9UPV9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TRAK1Q9UPV9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
TRAK1Q9UPV9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TRAK1Q9UPV9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
TRAK1Q9UPV9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TRAK1Q9UPV9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms