Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPT9

USP22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22Q9UPT9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP22Q9UPT9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP22Q9UPT9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP22Q9UPT9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms