Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM8

AP4E1, AP-4 complex subunit epsilon-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4E1Q9UPM8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP4E1Q9UPM8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP4E1Q9UPM8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP4E1Q9UPM8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP4E1Q9UPM8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP4E1Q9UPM8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP4E1Q9UPM8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
AP4E1Q9UPM8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP4E1Q9UPM8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP4E1Q9UPM8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP4E1Q9UPM8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP4E1Q9UPM8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
AP4E1Q9UPM8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP4E1Q9UPM8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP4E1Q9UPM8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP4E1Q9UPM8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP4E1Q9UPM8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP4E1Q9UPM8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP4E1Q9UPM8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP4E1Q9UPM8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP4E1Q9UPM8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP4E1Q9UPM8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP4E1Q9UPM8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP4E1Q9UPM8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP4E1Q9UPM8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP4E1Q9UPM8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP4E1Q9UPM8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP4E1Q9UPM8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP4E1Q9UPM8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP4E1Q9UPM8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP4E1Q9UPM8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP4E1Q9UPM8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP4E1Q9UPM8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP4E1Q9UPM8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP4E1Q9UPM8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP4E1Q9UPM8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP4E1Q9UPM8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP4E1Q9UPM8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP4E1Q9UPM8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP4E1Q9UPM8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP4E1Q9UPM8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
AP4E1Q9UPM8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
AP4E1Q9UPM8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP4E1Q9UPM8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP4E1Q9UPM8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP4E1Q9UPM8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
AP4E1Q9UPM8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP4E1Q9UPM8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP4E1Q9UPM8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
AP4E1Q9UPM8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP4E1Q9UPM8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP4E1Q9UPM8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP4E1Q9UPM8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP4E1Q9UPM8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP4E1Q9UPM8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
AP4E1Q9UPM8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP4E1Q9UPM8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP4E1Q9UPM8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP4E1Q9UPM8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP4E1Q9UPM8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP4E1Q9UPM8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP4E1Q9UPM8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP4E1Q9UPM8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP4E1Q9UPM8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP4E1Q9UPM8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP4E1Q9UPM8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP4E1Q9UPM8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP4E1Q9UPM8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP4E1Q9UPM8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP4E1Q9UPM8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP4E1Q9UPM8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP4E1Q9UPM8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP4E1Q9UPM8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP4E1Q9UPM8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP4E1Q9UPM8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP4E1Q9UPM8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP4E1Q9UPM8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
AP4E1Q9UPM8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP4E1Q9UPM8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
AP4E1Q9UPM8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP4E1Q9UPM8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP4E1Q9UPM8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP4E1Q9UPM8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP4E1Q9UPM8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP4E1Q9UPM8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP4E1Q9UPM8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP4E1Q9UPM8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP4E1Q9UPM8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP4E1Q9UPM8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP4E1Q9UPM8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP4E1Q9UPM8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP4E1Q9UPM8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP4E1Q9UPM8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP4E1Q9UPM8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP4E1Q9UPM8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP4E1Q9UPM8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP4E1Q9UPM8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP4E1Q9UPM8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP4E1Q9UPM8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP4E1Q9UPM8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms