Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FZD1Q9UP38 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FZD1Q9UP38 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FZD1Q9UP38 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FZD1Q9UP38 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FZD1Q9UP38 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FZD1Q9UP38 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FZD1Q9UP38 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FZD1Q9UP38 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FZD1Q9UP38 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FZD1Q9UP38 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FZD1Q9UP38 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FZD1Q9UP38 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FZD1Q9UP38 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FZD1Q9UP38 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FZD1Q9UP38 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FZD1Q9UP38 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FZD1Q9UP38 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FZD1Q9UP38 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FZD1Q9UP38 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FZD1Q9UP38 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FZD1Q9UP38 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FZD1Q9UP38 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FZD1Q9UP38 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FZD1Q9UP38 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FZD1Q9UP38 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FZD1Q9UP38 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
FZD1Q9UP38 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FZD1Q9UP38 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FZD1Q9UP38 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FZD1Q9UP38 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FZD1Q9UP38 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FZD1Q9UP38 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
FZD1Q9UP38 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FZD1Q9UP38 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FZD1Q9UP38 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
FZD1Q9UP38 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FZD1Q9UP38 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FZD1Q9UP38 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FZD1Q9UP38 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FZD1Q9UP38 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FZD1Q9UP38 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FZD1Q9UP38 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FZD1Q9UP38 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FZD1Q9UP38 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FZD1Q9UP38 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FZD1Q9UP38 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FZD1Q9UP38 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FZD1Q9UP38 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
FZD1Q9UP38 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms