Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTF2Q9UNY4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms