Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ALKQ9UM73 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ALKQ9UM73 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.74
ALKQ9UM73 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ALKQ9UM73 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ALKQ9UM73 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ALKQ9UM73 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ALKQ9UM73 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ALKQ9UM73 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ALKQ9UM73 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ALKQ9UM73 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ALKQ9UM73 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
ALKQ9UM73 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ALKQ9UM73 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
ALKQ9UM73 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ALKQ9UM73 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ALKQ9UM73 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ALKQ9UM73 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ALKQ9UM73 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
ALKQ9UM73 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
ALKQ9UM73 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ALKQ9UM73 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
ALKQ9UM73 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ALKQ9UM73 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ALKQ9UM73 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ALKQ9UM73 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ALKQ9UM73 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ALKQ9UM73 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ALKQ9UM73 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ALKQ9UM73 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ALKQ9UM73 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ALKQ9UM73 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
ALKQ9UM73 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
ALKQ9UM73 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ALKQ9UM73 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ALKQ9UM73 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ALKQ9UM73 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ALKQ9UM73 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ALKQ9UM73 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ALKQ9UM73 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
ALKQ9UM73 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ALKQ9UM73 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ALKQ9UM73 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ALKQ9UM73 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ALKQ9UM73 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ALKQ9UM73 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
ALKQ9UM73 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
ALKQ9UM73 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ALKQ9UM73 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ALKQ9UM73 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ALKQ9UM73 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ALKQ9UM73 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ALKQ9UM73 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ALKQ9UM73 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ALKQ9UM73 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
ALKQ9UM73 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ALKQ9UM73 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ALKQ9UM73 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
ALKQ9UM73 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ALKQ9UM73 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ALKQ9UM73 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ALKQ9UM73 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ALKQ9UM73 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ALKQ9UM73 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ALKQ9UM73 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ALKQ9UM73 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ALKQ9UM73 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ALKQ9UM73 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ALKQ9UM73 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ALKQ9UM73 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ALKQ9UM73 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ALKQ9UM73 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ALKQ9UM73 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ALKQ9UM73 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
ALKQ9UM73 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ALKQ9UM73 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ALKQ9UM73 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ALKQ9UM73 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ALKQ9UM73 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ALKQ9UM73 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ALKQ9UM73 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ALKQ9UM73 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ALKQ9UM73 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ALKQ9UM73 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ALKQ9UM73 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ALKQ9UM73 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ALKQ9UM73 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ALKQ9UM73 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ALKQ9UM73 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ALKQ9UM73 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ALKQ9UM73 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ALKQ9UM73 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ALKQ9UM73 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ALKQ9UM73 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ALKQ9UM73 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ALKQ9UM73 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ALKQ9UM73 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ALKQ9UM73 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
ALKQ9UM73 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ALKQ9UM73 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms