Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms