Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID6

ZNF639, Zinc finger protein 639, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF639Q9UID6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF639Q9UID6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF639Q9UID6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF639Q9UID6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF639Q9UID6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF639Q9UID6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF639Q9UID6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF639Q9UID6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF639Q9UID6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF639Q9UID6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF639Q9UID6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF639Q9UID6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZNF639Q9UID6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF639Q9UID6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF639Q9UID6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF639Q9UID6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF639Q9UID6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF639Q9UID6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF639Q9UID6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF639Q9UID6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF639Q9UID6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZNF639Q9UID6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF639Q9UID6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF639Q9UID6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF639Q9UID6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF639Q9UID6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF639Q9UID6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF639Q9UID6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms