Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX20Q9UHI6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DDX20Q9UHI6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DDX20Q9UHI6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DDX20Q9UHI6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX20Q9UHI6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX20Q9UHI6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX20Q9UHI6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX20Q9UHI6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX20Q9UHI6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX20Q9UHI6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX20Q9UHI6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX20Q9UHI6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX20Q9UHI6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX20Q9UHI6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX20Q9UHI6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX20Q9UHI6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX20Q9UHI6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX20Q9UHI6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX20Q9UHI6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX20Q9UHI6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX20Q9UHI6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX20Q9UHI6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX20Q9UHI6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX20Q9UHI6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX20Q9UHI6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX20Q9UHI6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX20Q9UHI6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX20Q9UHI6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX20Q9UHI6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX20Q9UHI6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX20Q9UHI6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX20Q9UHI6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX20Q9UHI6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX20Q9UHI6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX20Q9UHI6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX20Q9UHI6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX20Q9UHI6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX20Q9UHI6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms