Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ABCF2Q9UG63 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ABCF2Q9UG63 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCF2Q9UG63 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCF2Q9UG63 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCF2Q9UG63 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCF2Q9UG63 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCF2Q9UG63 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCF2Q9UG63 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCF2Q9UG63 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCF2Q9UG63 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCF2Q9UG63 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCF2Q9UG63 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCF2Q9UG63 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCF2Q9UG63 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCF2Q9UG63 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCF2Q9UG63 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCF2Q9UG63 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCF2Q9UG63 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCF2Q9UG63 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCF2Q9UG63 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCF2Q9UG63 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCF2Q9UG63 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCF2Q9UG63 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCF2Q9UG63 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCF2Q9UG63 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCF2Q9UG63 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCF2Q9UG63 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCF2Q9UG63 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCF2Q9UG63 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCF2Q9UG63 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCF2Q9UG63 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCF2Q9UG63 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCF2Q9UG63 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCF2Q9UG63 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCF2Q9UG63 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCF2Q9UG63 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCF2Q9UG63 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCF2Q9UG63 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCF2Q9UG63 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCF2Q9UG63 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCF2Q9UG63 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCF2Q9UG63 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCF2Q9UG63 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCF2Q9UG63 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCF2Q9UG63 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCF2Q9UG63 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms