Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC9

SPRR3, Small proline-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR3Q9UBC9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPRR3Q9UBC9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms