Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
IFNKQ9P0W0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFNKQ9P0W0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms