Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U3

SENP1, Sentrin-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1Q9P0U3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms