Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MSRB1Q9NZV6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms