Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
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TMOD4Q9NZQ9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMOD4Q9NZQ9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMOD4Q9NZQ9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMOD4Q9NZQ9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMOD4Q9NZQ9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMOD4Q9NZQ9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TMOD4Q9NZQ9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMOD4Q9NZQ9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMOD4Q9NZQ9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMOD4Q9NZQ9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMOD4Q9NZQ9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMOD4Q9NZQ9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMOD4Q9NZQ9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMOD4Q9NZQ9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMOD4Q9NZQ9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMOD4Q9NZQ9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMOD4Q9NZQ9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMOD4Q9NZQ9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TMOD4Q9NZQ9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TMOD4Q9NZQ9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TMOD4Q9NZQ9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMOD4Q9NZQ9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMOD4Q9NZQ9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMOD4Q9NZQ9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMOD4Q9NZQ9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMOD4Q9NZQ9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMOD4Q9NZQ9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMOD4Q9NZQ9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMOD4Q9NZQ9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMOD4Q9NZQ9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMOD4Q9NZQ9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMOD4Q9NZQ9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
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