Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXC10Q9NYD6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
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