Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms