Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX43Q9NXZ2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
DDX43Q9NXZ2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDX43Q9NXZ2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDX43Q9NXZ2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDX43Q9NXZ2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms