Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCM9Q9NXL9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms