Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLN6Q9NWW5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLN6Q9NWW5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms