Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLE1Q9NVX2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms