Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC3

SLC38A7, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 7, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A7Q9NVC3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC38A7Q9NVC3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC38A7Q9NVC3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms