Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms