Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
LMBRD1Q9NUN5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms