Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX2

MRPL17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL17Q9NRX2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPL17Q9NRX2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRPL17Q9NRX2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRPL17Q9NRX2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRPL17Q9NRX2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRPL17Q9NRX2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRPL17Q9NRX2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRPL17Q9NRX2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRPL17Q9NRX2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRPL17Q9NRX2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRPL17Q9NRX2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRPL17Q9NRX2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRPL17Q9NRX2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRPL17Q9NRX2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRPL17Q9NRX2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRPL17Q9NRX2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRPL17Q9NRX2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MRPL17Q9NRX2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRPL17Q9NRX2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRPL17Q9NRX2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRPL17Q9NRX2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRPL17Q9NRX2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRPL17Q9NRX2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRPL17Q9NRX2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRPL17Q9NRX2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRPL17Q9NRX2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MRPL17Q9NRX2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MRPL17Q9NRX2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRPL17Q9NRX2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRPL17Q9NRX2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRPL17Q9NRX2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms