Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
DUOX2Q9NRD8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
DUOX2Q9NRD8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
DUOX2Q9NRD8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
DUOX2Q9NRD8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
DUOX2Q9NRD8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
DUOX2Q9NRD8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
DUOX2Q9NRD8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
DUOX2Q9NRD8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
DUOX2Q9NRD8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
DUOX2Q9NRD8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
DUOX2Q9NRD8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
DUOX2Q9NRD8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC33.43■■■□□ 2.94
DUOX2Q9NRD8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
DUOX2Q9NRD8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
DUOX2Q9NRD8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
DUOX2Q9NRD8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
DUOX2Q9NRD8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
DUOX2Q9NRD8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
DUOX2Q9NRD8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
DUOX2Q9NRD8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
DUOX2Q9NRD8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
DUOX2Q9NRD8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
DUOX2Q9NRD8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
DUOX2Q9NRD8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
DUOX2Q9NRD8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
DUOX2Q9NRD8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
DUOX2Q9NRD8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
DUOX2Q9NRD8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
DUOX2Q9NRD8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
DUOX2Q9NRD8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
DUOX2Q9NRD8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
DUOX2Q9NRD8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
DUOX2Q9NRD8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
DUOX2Q9NRD8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
DUOX2Q9NRD8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
DUOX2Q9NRD8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms