Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT6

FSCN3, Fascin-3, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN3Q9NQT6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FSCN3Q9NQT6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms