Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT4

EXOSC5, Exosome complex component RRP46, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC5Q9NQT4 CCDC18-AS1-216ENST00000447577 431 ntTSL 56.07□□□□□ -1.449e-7■■■■■ 28.5
EXOSC5Q9NQT4 CCDC18-AS1-208ENST00000429859 418 ntTSL 55.49□□□□□ -1.539e-7■■■■■ 28.5
EXOSC5Q9NQT4 CCDC18-AS1-221ENST00000455474 299 ntTSL 34.05□□□□□ -1.769e-7■■■■■ 28.5
EXOSC5Q9NQT4 CCDC18-AS1-215ENST00000446528 489 ntTSL 53.98□□□□□ -1.779e-7■■■■■ 28.5
EXOSC5Q9NQT4 CCDC18-AS1-203ENST00000414430 427 ntTSL 33.3□□□□□ -1.889e-7■■■■■ 28.5
EXOSC5Q9NQT4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.32e-7■■■■■ 28.5
EXOSC5Q9NQT4 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.362e-7■■■■■ 28.5
EXOSC5Q9NQT4 CDK17-202ENST00000542666 1769 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.82e-7■■■■■ 28.5
EXOSC5Q9NQT4 CDK17-210ENST00000552262 566 ntTSL 38.76□□□□□ -1.012e-7■■■■■ 28.5
EXOSC5Q9NQT4 CDK17-211ENST00000552496 583 ntTSL 36.37□□□□□ -1.392e-7■■■■■ 28.5
EXOSC5Q9NQT4 CDK17-209ENST00000551816 626 ntTSL 42.63□□□□□ -1.992e-7■■■■■ 28.5
EXOSC5Q9NQT4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.231e-6■■■■■ 28.4
EXOSC5Q9NQT4 RSRC1-206ENST00000471994 769 ntTSL 57.79□□□□□ -1.161e-6■■■■■ 28.4
EXOSC5Q9NQT4 RSRC1-201ENST00000295930 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.171e-6■■■■■ 28.4
EXOSC5Q9NQT4 RSRC1-215ENST00000611884 1738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.171e-6■■■■■ 28.4
EXOSC5Q9NQT4 RSRC1-205ENST00000471911 931 ntTSL 27.54□□□□□ -1.21e-6■■■■■ 28.4
EXOSC5Q9NQT4 RSRC1-210ENST00000480119 1335 ntTSL 57.27□□□□□ -1.251e-6■■■■■ 28.4
EXOSC5Q9NQT4 RSRC1-202ENST00000312179 1443 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.281e-6■■■■■ 28.4
EXOSC5Q9NQT4 RSRC1-203ENST00000464171 2411 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.331e-6■■■■■ 28.4
EXOSC5Q9NQT4 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.651e-6■■■■■ 28.4
EXOSC5Q9NQT4 RSRC1-212ENST00000482822 792 ntTSL 24.28□□□□□ -1.721e-6■■■■■ 28.4
EXOSC5Q9NQT4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.791e-7■■■■■ 28.4
EXOSC5Q9NQT4 TRAP1-207ENST00000571804 781 ntTSL 518.42■□□□□ 0.541e-7■■■■■ 28.4
EXOSC5Q9NQT4 TRAP1-215ENST00000576106 555 ntTSL 418■□□□□ 0.471e-7■■■■■ 28.4
EXOSC5Q9NQT4 TRAP1-203ENST00000570403 521 ntTSL 417.89■□□□□ 0.451e-7■■■■■ 28.4
EXOSC5Q9NQT4 TRAP1-205ENST00000571011 480 ntTSL 516.49■□□□□ 0.231e-7■■■■■ 28.4
EXOSC5Q9NQT4 TRAP1-211ENST00000574941 558 ntTSL 415.73■□□□□ 0.111e-7■■■■■ 28.4
EXOSC5Q9NQT4 TRAP1-201ENST00000246957 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.691e-7■■■■■ 28.4
EXOSC5Q9NQT4 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.612e-8■■■■■ 28.4
EXOSC5Q9NQT4 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.812e-8■■■■■ 28.4
EXOSC5Q9NQT4 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.942e-8■■■■■ 28.4
EXOSC5Q9NQT4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.891e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.11e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 RPH3AL-216ENST00000575130 579 ntTSL 413.63□□□□□ -0.231e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 RNF4-210ENST00000508235 603 ntTSL 312.14□□□□□ -0.471e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 RPH3AL-212ENST00000573780 531 ntTSL 411.99□□□□□ -0.491e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.551e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 ZNF317-203ENST00000419608 744 ntTSL 211.37□□□□□ -0.591e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 RNF115-202ENST00000582693 9117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.621e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 TBC1D14-201ENST00000409757 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.681e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.711e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 TBC1D14-207ENST00000448507 4887 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.891e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 TBC1D14-202ENST00000410031 4201 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.911e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 CHD4-202ENST00000430771 527 ntTSL 49.12□□□□□ -0.951e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 TBC1D14-206ENST00000446947 4021 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.971e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 ZNF317-202ENST00000360385 3955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.051e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 TBC1D14-204ENST00000439515 602 ntTSL 58.47□□□□□ -1.051e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 ZNF317-201ENST00000247956 4073 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.181e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 AF279873.3-201ENST00000523063 766 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.312e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.331e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 ZNF317-205ENST00000591278 4186 ntTSL 1 (best)6.28□□□□□ -1.41e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.142e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.12e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 MICAL3-207ENST00000461307 5981 ntTSL 512.11□□□□□ -0.477e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 MICAL3-203ENST00000400561 3046 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.797e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 MICAL3-204ENST00000414725 4756 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.857e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 MICAL3-202ENST00000383094 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.937e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 MICAL3-219ENST00000585038 3323 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.247e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.283e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 ELP4-206ENST00000638317 450 ntTSL 312.9□□□□□ -0.343e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.43e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.493e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.573e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 ELP4-202ENST00000379163 1700 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.583e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 ELP4-217ENST00000639182 857 ntTSL 511.39□□□□□ -0.593e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 ELP4-214ENST00000638917 2306 ntTSL 511□□□□□ -0.653e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 ELP4-221ENST00000640081 2385 ntTSL 510.79□□□□□ -0.683e-7■■■■■ 28.3
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EXOSC5Q9NQT4 NOL10-201ENST00000345985 3333 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.731e-6■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 ELP4-222ENST00000640231 2062 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.733e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 ELP4-207ENST00000638347 1651 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.763e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.823e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 ELP4-205ENST00000638184 1330 ntTSL 59.4□□□□□ -0.93e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 NOL10-202ENST00000381685 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -11e-6■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 ELP4-215ENST00000638984 1330 ntTSL 57.94□□□□□ -1.143e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 ELP4-226ENST00000640790 1249 ntTSL 57.77□□□□□ -1.173e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 ELP4-229ENST00000640961 8164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.173e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 ELP4-216ENST00000639097 906 ntTSL 55.82□□□□□ -1.483e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 NOL10-203ENST00000431319 827 ntTSL 33.64□□□□□ -1.831e-6■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 ELP4-213ENST00000638828 4647 ntTSL 23.25□□□□□ -1.893e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 RALGPS2-209ENST00000495034 1970 ntTSL 214.92□□□□□ -0.022e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 RALGPS2-203ENST00000367634 7512 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.632e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 RALGPS2-201ENST00000324778 906 ntTSL 54.23□□□□□ -1.732e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.851e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.51e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.291e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.141e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.371e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 ZNF529-209ENST00000591340 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.61e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 RNF24-201ENST00000336095 7453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.611e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 RNF24-202ENST00000358395 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.691e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 EED-211ENST00000534595 713 ntTSL 39.82□□□□□ -0.841e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 ZNF529-201ENST00000334116 5238 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.871e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 ZNF529-205ENST00000586115 587 ntTSL 48.02□□□□□ -1.131e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 ZNF529-203ENST00000585960 535 ntTSL 47.75□□□□□ -1.171e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 RNF24-203ENST00000432261 3149 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.21e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.531e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 EED-204ENST00000524673 1155 ntTSL 35.42□□□□□ -1.541e-7■■■■■ 28.3
EXOSC5Q9NQT4 ZNF529-204ENST00000585983 582 ntTSL 35.26□□□□□ -1.571e-7■■■■■ 28.3
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