Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC52A2Q9HAB3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms