Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3Q1

CDC42EP4, Cdc42 effector protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP4Q9H3Q1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC42EP4Q9H3Q1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42EP4Q9H3Q1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP4Q9H3Q1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms