Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTDSP1Q9GZU7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms