Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU3

TMEM39B, Transmembrane protein 39B, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39BQ9GZU3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM39BQ9GZU3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.6 ms