Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE2OQ9C0C9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE2OQ9C0C9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms